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细菌基因组DNA提取实验准备 - 尊龙凯时人生就博

发布时间:2025-03-01   信息来源:尊龙凯时官方编辑

在细菌基因组DNA提取实验中,经过细菌的培养与收集,我们获得了足够数量的样本。接下来,关键步骤是细胞裂解,其目的是破坏细菌的细胞壁和细胞膜,释放出DNA。我们采用了化学和物理方法的结合,首先使用特定酶类处理样本,这些酶能够特异性降解细菌的细胞壁成分。随后,通过超声波或法式压碎法进一步打破细胞,以确保DNA的充分释放。

细菌基因组DNA提取实验准备 - 尊龙凯时人生就博

完成细胞裂解后,接下来的挑战是如何有效地分离和纯化DNA。通过利用DNA在不同盐浓度和pH值下的溶解度差异,经过一系列有机溶剂提取步骤,可以有效去除蛋白质和多糖等杂质,同时保护DNA免受降解。每一步操作都需谨慎,避免剧烈振荡,以防止DNA断裂。

试剂盒组成与储存

1. 说明书及耗材:DNA制备管、小型滤器、2ml离心管、15ml离心管。

2. RNaseA:50mg/ml,室温保存。

3. *:50%甘油溶解*,配置为50mg/ml,-20℃密闭储存。

4. BufferS:细菌原生质制备液,加入RNaseA后,4℃密闭储存。

5. 025MEDTA:室温密闭储存。

6. BufferG-A:裂解液,室温密闭储存。

7. BufferG-B:蛋白去除液,室温密闭储存。

8. BufferDV-A:BufferDV的制备液,参照实验准备BufferDV的配制方法,室温密闭储存。

9. BufferDV:相分离液,室温密闭储存。

10. BufferBV:DNA结合液,室温密闭储存。

11. BufferW1:洗涤液,室温密闭储存。

12. BufferW2concentrate:去盐液。使用前按瓶上说明加入无水乙醇并混合均匀,室温密闭储存。

13. Eluent:25mM Tris-HCl,pH 8.5,室温密闭储存。

实验准备

1. 第一次使用时,在BufferW2中按瓶上说明加入无水乙醇并混合均匀。

2. 准备BufferDV:取2ml BufferDV-A,125ml异丙醇和75ml,放入提供的250ml试剂瓶中,混合均匀。

3. 预冷BufferDV至4℃。

4. 第一次使用试剂盒时,用50%甘油溶解*至50mg/ml。

5. 第一次使用试剂盒时将RNaseA全部加入BufferS中,混合均匀。

6. 准备65℃水浴。

7. 检查BufferG-A和BufferG-B是否有沉淀,如有,则于65℃水浴加热至沉淀溶解后再使用。

8. 将Eluent或去离子水加热至65℃以促进基因组DNA的充分洗脱。

操作步骤

1. 用2ml离心管收集10×109(1ml菌液OD600为1-15)的细菌培养物,12000×g离心30秒,弃去上清。用150μl已加入RNaseA的BufferS悬浮沉淀,确保均匀,不留小菌块,以免影响溶菌效果。

2. 加入20μl *贮存液,混合均匀后,室温静置5分钟。

3. 加入30μl 025MEDTA(pH 8.0),混合均匀,冰浴5分钟。

4. 加入450μl BufferG-A,旋涡振荡15秒,在65℃水浴下孵育10分钟。

5. 加入400μl BufferG-B和1ml 4℃预冷的BufferDV,用力混合,12000×g离心2分钟。

6. 尽可能丢弃上相,保留相间沉淀和下相,再加入1ml 4℃预冷的BufferDV,混合后再12000×g离心2分钟。

7. 丢弃上相,将下相转移至滤器(滤器置于2ml离心管中),12000×g离心1分钟。

8. 往滤液中加入400μl BufferBV,混合均匀。之后可选择负压法或离心法进行后续的清洗与脱盐处理。

通过乙醇沉淀法将提纯的DNA从溶液中析出,需在低温下操作以促进DNA的凝聚和沉淀。沉淀后,用70%乙醇洗涤多次,以去除残留盐分和有机溶剂,这对于确保DNA纯度至关重要。

最终,将洗涤后的DNA沉淀晾干,溶解于适量的TE缓冲液中,即得到了较为纯净的细菌基因组DNA溶液。经过电泳检测,可以直观观察到DNA的条带清晰度与完整性,进而评估提取效果。至此,整个细菌基因组DNA提取实验顺利结束,为后续的分子生物学研究奠定了坚实的基础。对于使用尊龙凯时人生就博的品牌用户来说,这一过程的高效性与可靠性将有效提升实验质量。